MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium acetobutylicum EA 2018 chromosome

Total Repeats: 101638

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017295	ATT	2	6	79	84	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017295	A	8	8	90	97	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017295	TACC	2	8	121	128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017295	ATT	2	6	140	145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017295	TAA	2	6	159	164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017295	T	6	6	166	171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017295	ATTTT	2	10	224	233	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017295	T	10	10	230	239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017295	ATTA	2	8	246	253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017295	ATT	2	6	281	286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017295	T	6	6	352	357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017295	TTG	2	6	417	422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017295	TTTA	2	8	428	435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017295	AAAT	2	8	436	443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017295	T	7	7	443	449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017295	AGG	2	6	454	459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017295	A	6	6	495	500	100 %	0 %	0 %	0 %	384456719
18	NC_017295	ATA	2	6	509	514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
19	NC_017295	TAA	3	9	651	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
20	NC_017295	ATA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
21	NC_017295	ACT	2	6	677	682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456719
22	NC_017295	A	6	6	683	688	100 %	0 %	0 %	0 %	384456719
23	NC_017295	GAA	2	6	716	721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456719
24	NC_017295	ACAA	2	8	755	762	75 %	0 %	0 %	25 %	384456719
25	NC_017295	TTC	2	6	781	786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456719
26	NC_017295	GTAATA	2	12	828	839	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384456719
27	NC_017295	TGC	2	6	850	855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384456719
28	NC_017295	TTGCTG	2	12	861	872	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384456719
29	NC_017295	ATT	2	6	898	903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456719
30	NC_017295	TA	3	6	904	909	50 %	50 %	0 %	0 %	384456719
31	NC_017295	GGA	2	6	911	916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456719
32	NC_017295	ATA	2	6	969	974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
33	NC_017295	TCT	2	6	1001	1006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456719
34	NC_017295	GAC	2	6	1043	1048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456719
35	NC_017295	TGA	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456719
36	NC_017295	GTTCA	2	10	1106	1115	20 %	40 %	20 %	20 %	384456719
37	NC_017295	AAG	2	6	1137	1142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456719
38	NC_017295	T	6	6	1145	1150	0 %	100 %	0 %	0 %	384456719
39	NC_017295	AACA	2	8	1178	1185	75 %	0 %	0 %	25 %	384456719
40	NC_017295	ACC	2	6	1207	1212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384456719
41	NC_017295	GGA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456719
42	NC_017295	A	6	6	1319	1324	100 %	0 %	0 %	0 %	384456719
43	NC_017295	AG	3	6	1397	1402	50 %	0 %	50 %	0 %	384456719
44	NC_017295	TTTAA	2	10	1559	1568	40 %	60 %	0 %	0 %	384456719
45	NC_017295	A	6	6	1600	1605	100 %	0 %	0 %	0 %	384456719
46	NC_017295	AACT	2	8	1647	1654	50 %	25 %	0 %	25 %	384456719
47	NC_017295	GGA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456719
48	NC_017295	A	6	6	1725	1730	100 %	0 %	0 %	0 %	384456719
49	NC_017295	TCT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384456719
50	NC_017295	AGA	2	6	1747	1752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456719
51	NC_017295	TGA	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456719
52	NC_017295	TC	3	6	1794	1799	0 %	50 %	0 %	50 %	384456719
53	NC_017295	ATA	2	6	1804	1809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456719
54	NC_017295	GTT	2	6	1813	1818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017295	TAT	2	6	1819	1824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017295	TAA	2	6	1832	1837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017295	AGT	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017295	TAA	2	6	1901	1906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017295	T	7	7	1921	1927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017295	TTG	2	6	1945	1950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017295	CAA	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017295	CTA	3	9	1983	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017295	TAC	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017295	TAT	2	6	2007	2012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017295	TAA	2	6	2045	2050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017295	GGA	2	6	2051	2056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017295	TAT	2	6	2057	2062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017295	A	7	7	2080	2086	100 %	0 %	0 %	0 %	384456720
69	NC_017295	AAG	2	6	2095	2100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
70	NC_017295	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456720
71	NC_017295	CAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384456720
72	NC_017295	AAAT	2	8	2230	2237	75 %	25 %	0 %	0 %	384456720
73	NC_017295	AGA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
74	NC_017295	GTT	2	6	2262	2267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456720
75	NC_017295	AAT	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
76	NC_017295	AAT	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
77	NC_017295	TAA	2	6	2363	2368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
78	NC_017295	A	6	6	2455	2460	100 %	0 %	0 %	0 %	384456720
79	NC_017295	AAATT	2	10	2556	2565	60 %	40 %	0 %	0 %	384456720
80	NC_017295	AAG	2	6	2597	2602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
81	NC_017295	TTA	2	6	2665	2670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456720
82	NC_017295	GAT	2	6	2682	2687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456720
83	NC_017295	AT	3	6	2719	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	384456720
84	NC_017295	ATA	2	6	2748	2753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
85	NC_017295	ACT	2	6	2759	2764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384456720
86	NC_017295	AAT	2	6	2792	2797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456720
87	NC_017295	GAA	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
88	NC_017295	AGA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
89	NC_017295	AG	4	8	2855	2862	50 %	0 %	50 %	0 %	384456720
90	NC_017295	GAT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456720
91	NC_017295	AGA	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
92	NC_017295	AATA	2	8	2969	2976	75 %	25 %	0 %	0 %	384456720
93	NC_017295	GAA	2	6	3054	3059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456720
94	NC_017295	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456720
95	NC_017295	ATG	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456720
96	NC_017295	AGG	2	6	3177	3182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017295	A	6	6	3183	3188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017295	AAGT	2	8	3202	3209	50 %	25 %	25 %	0 %	384456721
99	NC_017295	TA	3	6	3288	3293	50 %	50 %	0 %	0 %	384456721
100	NC_017295	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456721
101	NC_017295	AT	3	6	3348	3353	50 %	50 %	0 %	0 %	384456721
102	NC_017295	TAA	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017295	TTA	2	6	3442	3447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456722
104	NC_017295	TA	3	6	3450	3455	50 %	50 %	0 %	0 %	384456722
105	NC_017295	A	6	6	3455	3460	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
106	NC_017295	ATA	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
107	NC_017295	TAA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
108	NC_017295	A	6	6	3513	3518	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
109	NC_017295	AAT	2	6	3537	3542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
110	NC_017295	ATAAGG	2	12	3610	3621	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384456722
111	NC_017295	TTA	2	6	3625	3630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456722
112	NC_017295	A	7	7	3687	3693	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
113	NC_017295	A	6	6	3720	3725	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
114	NC_017295	ATAAAT	2	12	3729	3740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
115	NC_017295	A	6	6	3752	3757	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
116	NC_017295	GTT	2	6	3767	3772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456722
117	NC_017295	AGA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456722
118	NC_017295	ATT	2	6	3886	3891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456722
119	NC_017295	ATA	2	6	3907	3912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
120	NC_017295	A	6	6	3948	3953	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
121	NC_017295	ATGAT	2	10	3964	3973	40 %	40 %	20 %	0 %	384456722
122	NC_017295	ATG	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456722
123	NC_017295	AGC	2	6	3988	3993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384456722
124	NC_017295	ATTC	2	8	4068	4075	25 %	50 %	0 %	25 %	384456722
125	NC_017295	AGA	2	6	4148	4153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456722
126	NC_017295	ATT	2	6	4154	4159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384456722
127	NC_017295	TTTA	2	8	4163	4170	25 %	75 %	0 %	0 %	384456722
128	NC_017295	AAAT	2	8	4243	4250	75 %	25 %	0 %	0 %	384456722
129	NC_017295	TGA	2	6	4370	4375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456722
130	NC_017295	AT	4	8	4409	4416	50 %	50 %	0 %	0 %	384456722
131	NC_017295	TAA	2	6	4444	4449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384456722
132	NC_017295	A	6	6	4484	4489	100 %	0 %	0 %	0 %	384456722
133	NC_017295	AGG	2	6	4546	4551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384456723
134	NC_017295	GTT	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456723
135	NC_017295	AGA	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384456723
136	NC_017295	GGAT	2	8	4677	4684	25 %	25 %	50 %	0 %	384456723
137	NC_017295	TTG	2	6	4685	4690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456723
138	NC_017295	GTT	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384456723
139	NC_017295	AGG	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_017295	ATG	2	6	4866	4871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384456724
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